13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09620 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  100 
 
 
302 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  26.24 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2847  RDD family membrane protein  27.27 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2976  RDD domain-containing protein  36.61 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0648796  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3018  RDD domain-containing protein  36.61 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.792244  normal  0.129954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.77 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  25.45 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  26.85 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  39.44 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  27.71 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  23.7 
 
 
242 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  32 
 
 
306 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>