21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0008 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  346  7e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  34.27 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  26.25 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  27.39 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  29.38 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  26.42 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  32.61 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  29.76 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0732  RDD domain-containing protein  28.49 
 
 		 248 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.70222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  32.41 
 
 		 270 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  26.25 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  31.03 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  31.21 
 
 		 254 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  25.52 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  24.36 
 
 		 217 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.38 
 
 		 257 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0949  hypothetical protein  24.36 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 323 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>