14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0288 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  45.08 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  43.98 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  28.49 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.21 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  32.76 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  27.74 
 
 		 175 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  28.72 
 
 		 174 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  23.03 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  35.06 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  23.26 
 
 		 393 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  31 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.7 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>