26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1692 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  41.86 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  32.11 
 
 
260 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  35.66 
 
 
235 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  34.38 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  31.3 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  36.51 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  31.94 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
616 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  33.98 
 
 
123 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  28 
 
 
230 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  34.11 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  34.11 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
613 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  27.03 
 
 
191 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0369  hypothetical protein  34 
 
 
127 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  29.01 
 
 
226 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4343  hypothetical protein  29.67 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
520 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1602  hypothetical protein  28.79 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2854  hypothetical protein  26.24 
 
 
179 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000499233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1146  hypothetical protein  25.58 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000825613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  29.29 
 
 
187 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  36.21 
 
 
1888 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  30.48 
 
 
228 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.99 
 
 
438 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>