23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3580 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
613 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  41.06 
 
 
239 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  40.79 
 
 
207 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
520 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  28.86 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  33.7 
 
 
226 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  36.36 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
616 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  29.67 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  39.69 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  31.3 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  34.36 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  33.87 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  29.57 
 
 
331 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  29.57 
 
 
331 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1146  hypothetical protein  30 
 
 
434 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000825613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1255  hypothetical protein  27.87 
 
 
439 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  34.07 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  25.66 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0997  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4309  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>