28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1609 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  889    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  35.82 
 
 
471 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.23 
 
 
449 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.72 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.75 
 
 
451 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  33.89 
 
 
440 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  27.99 
 
 
441 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  30.08 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.19 
 
 
5216 aa  133  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.42 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.73 
 
 
407 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.29 
 
 
426 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1698  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.21 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00849599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.32 
 
 
513 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  28.05 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.98 
 
 
520 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.68 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  27.85 
 
 
678 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.18 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.3 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  27.63 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  28.08 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.26 
 
 
308 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  26.68 
 
 
598 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2900  hypothetical protein  23.41 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  35.92 
 
 
870 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4660  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  23.5 
 
 
502 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.673229  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2849  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.87 
 
 
523 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>