More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2490 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 
833 aa  1630    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  48.7 
 
 
1462 aa  276  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  60.31 
 
 
220 aa  242  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  42.9 
 
 
561 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 
589 aa  224  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  55.91 
 
 
232 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  53.55 
 
 
207 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  53.55 
 
 
207 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  30.29 
 
 
792 aa  194  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  37.1 
 
 
425 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  47.15 
 
 
353 aa  172  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  44.79 
 
 
369 aa  168  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  43.5 
 
 
530 aa  164  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  46.88 
 
 
354 aa  158  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  47.21 
 
 
356 aa  156  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  40.61 
 
 
387 aa  150  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  41.78 
 
 
364 aa  150  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  44.9 
 
 
319 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.25 
 
 
1043 aa  148  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.9 
 
 
767 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  41.3 
 
 
322 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  34.62 
 
 
477 aa  137  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  44.83 
 
 
398 aa  135  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  44.74 
 
 
352 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  36.73 
 
 
526 aa  124  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  39.08 
 
 
342 aa  124  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  37 
 
 
351 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  31.99 
 
 
854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  32.98 
 
 
340 aa  111  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  40.28 
 
 
516 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.96 
 
 
1236 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  39.86 
 
 
447 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  37.76 
 
 
1050 aa  99.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  33.72 
 
 
346 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  40.56 
 
 
346 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  39.73 
 
 
465 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  32.63 
 
 
465 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  39.86 
 
 
342 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  38.73 
 
 
848 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  36.31 
 
 
308 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  37.93 
 
 
343 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  34.72 
 
 
469 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  33.73 
 
 
460 aa  92  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  34.78 
 
 
452 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  31.43 
 
 
418 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  34.43 
 
 
1712 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  34.03 
 
 
499 aa  89  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  38.26 
 
 
363 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  36.05 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  38.36 
 
 
641 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  33.33 
 
 
594 aa  85.1  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  29.87 
 
 
1503 aa  83.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  32.39 
 
 
738 aa  84  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  30.53 
 
 
283 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  30.21 
 
 
273 aa  83.2  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  30.99 
 
 
743 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  32.35 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  32.35 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  31.71 
 
 
197 aa  77.4  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  34.97 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.33 
 
 
2954 aa  75.5  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  54.93 
 
 
959 aa  74.3  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.35 
 
 
1582 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  31.51 
 
 
292 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  55.06 
 
 
3619 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  55.06 
 
 
3619 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  58.73 
 
 
2542 aa  72  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.16 
 
 
3427 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.56 
 
 
2775 aa  71.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  48.96 
 
 
813 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  54.93 
 
 
860 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 
946 aa  71.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  52.11 
 
 
1019 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.3 
 
 
3209 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  59.09 
 
 
1480 aa  70.5  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50 
 
 
2667 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  30.92 
 
 
332 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  61.67 
 
 
7679 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  34 
 
 
685 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  54.95 
 
 
950 aa  69.7  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  34 
 
 
549 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  28.85 
 
 
644 aa  69.7  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.34 
 
 
595 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.62 
 
 
1544 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 
757 aa  68.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  57.63 
 
 
4678 aa  68.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.32 
 
 
682 aa  68.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.64 
 
 
855 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.91 
 
 
1055 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 
4334 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  27.99 
 
 
1286 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.7 
 
 
3954 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.86 
 
 
1963 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  55.93 
 
 
5218 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  45 
 
 
1814 aa  66.6  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55.93 
 
 
5962 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  55.38 
 
 
1166 aa  66.6  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.57 
 
 
485 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  43.66 
 
 
424 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>