78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1620 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1620  patatin  100 
 
 
686 aa  1403    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  44.48 
 
 
320 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  38.12 
 
 
302 aa  207  5e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  38.01 
 
 
309 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  32.86 
 
 
334 aa  171  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  35.21 
 
 
342 aa  163  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  33.73 
 
 
337 aa  163  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  31.58 
 
 
365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  29.82 
 
 
340 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  26.74 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  29.86 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  32.63 
 
 
356 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  31.52 
 
 
390 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  37.68 
 
 
336 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  37.68 
 
 
336 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  36.4 
 
 
336 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  32.73 
 
 
312 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  30.27 
 
 
371 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  30.27 
 
 
371 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  32.22 
 
 
376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  30.27 
 
 
371 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  28.61 
 
 
374 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  32.6 
 
 
344 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.31 
 
 
1002 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  30.74 
 
 
358 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  32.14 
 
 
366 aa  105  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  32.59 
 
 
344 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  28.97 
 
 
333 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  28.18 
 
 
337 aa  101  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  30.41 
 
 
311 aa  101  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 
332 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 
332 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 
332 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 
332 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  31.79 
 
 
397 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 
375 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 
332 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  32.45 
 
 
354 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  31.21 
 
 
329 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  25.81 
 
 
326 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.58 
 
 
554 aa  96.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  27.64 
 
 
340 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  32 
 
 
343 aa  91.3  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  27.78 
 
 
308 aa  90.9  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  29.57 
 
 
324 aa  88.2  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  29.78 
 
 
333 aa  87.8  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  30.66 
 
 
367 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  27.04 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  26.23 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  25 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  29.92 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  25.25 
 
 
1678 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  26.09 
 
 
382 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  29.1 
 
 
786 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  34.48 
 
 
2503 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  24.1 
 
 
320 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 
3699 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  23.59 
 
 
714 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
3699 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  23.58 
 
 
283 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  23.96 
 
 
4761 aa  58.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.7 
 
 
6678 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  33.33 
 
 
2272 aa  54.3  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 
350 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.37 
 
 
11716 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25.35 
 
 
446 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  26.14 
 
 
2223 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  41.56 
 
 
615 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  24.66 
 
 
1113 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  28.44 
 
 
678 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  26.48 
 
 
363 aa  47.8  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  24.12 
 
 
429 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  23.98 
 
 
299 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 
864 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  25 
 
 
306 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 
864 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  26.39 
 
 
864 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1512  FAD-binding protein  26.39 
 
 
274 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.592661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>