33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1973 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1973  tail collar domain-containing protein  100 
 
 
934 aa  1898    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  42.6 
 
 
865 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  42.73 
 
 
1374 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  27.81 
 
 
671 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3381  tail collar domain-containing protein  35.36 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  hitchhiker  0.000000000100675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  40.74 
 
 
268 aa  67.4  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  29.14 
 
 
170 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  28.41 
 
 
172 aa  56.6  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0296  hypothetical protein  29.2 
 
 
289 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05505  lysyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 
293 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0927003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  24.56 
 
 
166 aa  54.7  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  29.01 
 
 
163 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  27.84 
 
 
171 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.24 
 
 
4761 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  26.67 
 
 
157 aa  52.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  30.51 
 
 
176 aa  52  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  26.82 
 
 
170 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  25.47 
 
 
168 aa  51.2  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  28.57 
 
 
169 aa  51.2  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  30.23 
 
 
6678 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  28.89 
 
 
178 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  25 
 
 
165 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  29.12 
 
 
181 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  28.8 
 
 
182 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  26.71 
 
 
169 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  26.35 
 
 
169 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  28.73 
 
 
179 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  27.06 
 
 
163 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  27.71 
 
 
183 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  26.55 
 
 
172 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  26.97 
 
 
174 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15450  hypothetical protein  30.83 
 
 
166 aa  45.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.519669  normal  0.0109811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  30.71 
 
 
176 aa  44.3  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>