14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03210 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03210  Ran GTPase activator, putative  100 
 
 		 404 aa  811    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04862  Ran specific GTPase activating protein An-RanGAP (Eurofung)  46.7 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.863304  normal  0.748765 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81269  predicted protein  39.02 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.446768  normal  0.64637 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2293  predicted protein  31.9 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.531902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  31.28 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54869  predicted protein  25.78 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  25.9 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  25.67 
 
 		 692 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  27.31 
 
 		 241 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  28.29 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  26.13 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  27.12 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  26.03 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_003296  RS01686  GALA protein 1  25.89 
 
 		 661 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>