14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0440 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1223  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  780    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0619  heat shock protein DnaJ domain protein  59.01 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.480443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0678  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.01 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0734  heat shock protein DnaJ domain protein  59.01 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0612  heat shock protein DnaJ domain protein  59.01 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0668  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  59.01 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3523  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.55 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4125  heat shock protein DnaJ domain protein  26.42 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00694826  hitchhiker  0.0000294861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.83 
 
 		 248 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  34.26 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3263  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.46 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 962 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>