45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1833 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  293  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  52.82 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  46.48 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  42.96 
 
 		 155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  41.96 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  41.55 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  41.55 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  35.92 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  39.19 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  37.41 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  36.05 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  30.82 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  36.11 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  35.42 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  32.17 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  32.62 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  39.44 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  26.06 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  40.65 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  28.06 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  34.9 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  30.14 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  34.53 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  29.32 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  25.85 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  26.21 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  31.08 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  29.29 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  25.87 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  26.03 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  32.39 
 
 		 456 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  27.82 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3125  hypothetical protein  30.37 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.271639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>