38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1798 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  82.55 
 
 		 151 aa  223  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  69.8 
 
 		 151 aa  201  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  61.94 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  56.08 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  43.75 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  38.85 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  38.81 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  36.96 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  33.81 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  35.42 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  36.23 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  36.23 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  30.99 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  31.34 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  35.51 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  28.67 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  30.94 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  30.88 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  28.26 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  32.87 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  28.28 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  29.6 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  34.38 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  30.6 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  32.84 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  30.6 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  29.66 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  29.46 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  27.59 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  29.73 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>