35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  250  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  41.54 
 
 
155 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  41.86 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  40.31 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  39.52 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  38.64 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  43.41 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  43.41 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  37.21 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  34.11 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  37.21 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  40.65 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  35.43 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  34.4 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  31.78 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  28.93 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  29.6 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  29.2 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  28.91 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  30.71 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  36.84 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  34.71 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  38.84 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  28.68 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  29.31 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  25.23 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0694  hypothetical protein  30.1 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  28.07 
 
 
144 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3125  hypothetical protein  26.92 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.271639  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  28.68 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>