34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2835 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  61.49 
 
 		 157 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  56.34 
 
 		 151 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  56.08 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  58.04 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  41.26 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  36.3 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  34.04 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  30.15 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  36.09 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  31.94 
 
 		 150 aa  72  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  37.12 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  33.81 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  35.82 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  34.78 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  37.21 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  36.09 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  35.34 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  35.34 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  37.74 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  34.25 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  34.59 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  32.09 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  36.99 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  29.8 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  28.89 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  37.74 
 
 		 155 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  29.01 
 
 		 156 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>