40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1560 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  33.85 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  35.56 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  32.31 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  34.04 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  34 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  37.33 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  35.17 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  37.75 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  29.13 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  33.86 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  32.85 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  34.29 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  33.57 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  29.08 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  26.06 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  28.93 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  32.87 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  29.13 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1659  hypothetical protein  26.95 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  29.84 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  27.66 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  31.97 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  35.04 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  32.09 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  34.48 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  31.39 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3125  hypothetical protein  30.22 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.271639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>