44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0698 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  292  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  95.89 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  59.72 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  60.81 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  52.55 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  48.89 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  41.84 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  41.18 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  40.43 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  41.3 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  41.3 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  44.36 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  38.85 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  38.03 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  32.31 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  35 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  44.57 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  37.78 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  32.12 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  38.64 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  32.82 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  32.82 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  28.26 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  26.67 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  30.94 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  31.65 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  37.04 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  29.29 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  53.66 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  28.68 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  31.3 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3125  hypothetical protein  26.24 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.271639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  47.22 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  34.07 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  47.22 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  47.22 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>