43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1641 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  60 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  59.72 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  59.86 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  51.43 
 
 
146 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  48.55 
 
 
146 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  47.55 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  43.36 
 
 
151 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  40.44 
 
 
147 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  43.84 
 
 
151 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  48.53 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  42.18 
 
 
160 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  38.46 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  38.3 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  43.75 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  51.52 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  41.26 
 
 
182 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  34.38 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  38.97 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  41.24 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  30.28 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  31.34 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  32.09 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  31.3 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  30.56 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  34.33 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  36.64 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  29.79 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  30.99 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  32.82 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  28.93 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  31.78 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  30.3 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  31.06 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  29.33 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  32.61 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  31.65 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  32.61 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  28.76 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>