32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0930 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  61.64 
 
 
161 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  55.56 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  39.46 
 
 
162 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  56.76 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  29.79 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  34.29 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  35.57 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  31.76 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  32.88 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  32.88 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  28.78 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  27.15 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  27.97 
 
 
150 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  31.54 
 
 
146 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  33.56 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  31.76 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  31.85 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  29.33 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  27.03 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  33.1 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  34 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  30.37 
 
 
182 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>