45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0709 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  95.89 
 
 		 147 aa  279  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  60 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  61.9 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  52.21 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  49.63 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  41.84 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  41.96 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  39.01 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  38.24 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  84  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  45.92 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  43.16 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  37.21 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  35.61 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  34.11 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  33.59 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  29.71 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  32.37 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  26.67 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  31.01 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  30.94 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  29.46 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  53.66 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  31.3 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3125  hypothetical protein  26.21 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.271639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  28.15 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  34.07 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  40.43 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  40.43 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1026  hypothetical protein  32.58 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>