44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3242 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  278  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  278  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  97.93 
 
 
145 aa  253  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  54.17 
 
 
152 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  48.95 
 
 
146 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  46.85 
 
 
160 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  43.48 
 
 
155 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  40.15 
 
 
146 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  41.26 
 
 
158 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  42.25 
 
 
159 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  41.3 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  41.61 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  41.13 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  36.88 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  35.42 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  37.96 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  36.96 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  41.04 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  32.12 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  36.23 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  36.96 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  37.76 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  28.79 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  35.34 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  34.88 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  30.08 
 
 
156 aa  59.3  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  35.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  32.37 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  29.93 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  35.46 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  43.41 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  31.34 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  34.51 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  28.87 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  34.56 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  31.51 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  32.87 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  30.43 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  30.22 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1200  hypothetical protein  31.47 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>