22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1624 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1318    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  30.47 
 
 		 683 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  24.7 
 
 		 1160 aa  106  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  23.58 
 
 		 885 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  28.65 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  29.41 
 
 		 997 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  48.48 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  32.56 
 
 		 885 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  45.45 
 
 		 892 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  31.25 
 
 		 980 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  25.24 
 
 		 766 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  28.1 
 
 		 1182 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  29.17 
 
 		 1068 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  26.45 
 
 		 316 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  30.36 
 
 		 765 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.22 
 
 		 367 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  28.66 
 
 		 953 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  26.19 
 
 		 922 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.89 
 
 		 944 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  22.04 
 
 		 997 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 		 1074 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>