12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0550 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  100 
 
 		 766 aa  1605    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  38.42 
 
 		 885 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  24.18 
 
 		 944 aa  85.9  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  23.89 
 
 		 980 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  44.29 
 
 		 892 aa  63.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  46.55 
 
 		 997 aa  62  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  25.24 
 
 		 646 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 		 1160 aa  55.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  28.23 
 
 		 683 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  31.58 
 
 		 885 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  25.7 
 
 		 417 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  38.18 
 
 		 730 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>