20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1217 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  43.03 
 
 		 944 aa  706    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  100 
 
 		 997 aa  2044    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  31.15 
 
 		 892 aa  312  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  28.6 
 
 		 980 aa  295  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  28.68 
 
 		 885 aa  283  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  22.99 
 
 		 1160 aa  74.7  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  30.24 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  30.73 
 
 		 954 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.72 
 
 		 1004 aa  70.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  29.41 
 
 		 646 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  44.19 
 
 		 683 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  24.38 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  46.55 
 
 		 766 aa  62  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  49.12 
 
 		 885 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.07 
 
 		 442 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.2 
 
 		 442 aa  48.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.62 
 
 		 997 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.27 
 
 		 446 aa  45.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.27 
 
 		 446 aa  45.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.27 
 
 		 446 aa  44.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>