80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3713 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 997 aa  2019    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  23.34 
 
 		 944 aa  82.4  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  22.32 
 
 		 683 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34.82 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  30.58 
 
 		 430 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.85 
 
 		 430 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  24.3 
 
 		 892 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  25.81 
 
 		 354 aa  55.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 431 aa  55.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.85 
 
 		 430 aa  55.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.85 
 
 		 430 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  29.75 
 
 		 430 aa  55.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 434 aa  55.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.93 
 
 		 292 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  22.96 
 
 		 450 aa  54.7  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 434 aa  54.7  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 432 aa  54.3  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.33 
 
 		 437 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 431 aa  53.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.22 
 
 		 426 aa  53.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 431 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  22.24 
 
 		 646 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.84 
 
 		 450 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.84 
 
 		 446 aa  52.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  31.34 
 
 		 431 aa  52  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  29.58 
 
 		 415 aa  50.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.33 
 
 		 429 aa  51.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  32.56 
 
 		 313 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 433 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 433 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 430 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 463 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 430 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 431 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 463 aa  49.7  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.61 
 
 		 497 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  35.16 
 
 		 434 aa  49.7  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.6 
 
 		 463 aa  49.3  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 427 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  29.03 
 
 		 518 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  26.72 
 
 		 450 aa  48.5  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  29.69 
 
 		 434 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  20.77 
 
 		 885 aa  48.5  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  29.1 
 
 		 425 aa  48.5  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  29.69 
 
 		 434 aa  48.5  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  30 
 
 		 408 aa  48.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 461 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  27.91 
 
 		 954 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  32.97 
 
 		 316 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  29.63 
 
 		 1067 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  29.69 
 
 		 434 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  25.62 
 
 		 997 aa  47.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.3 
 
 		 438 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.67 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  33.08 
 
 		 451 aa  47  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  36.56 
 
 		 444 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.31 
 
 		 340 aa  47  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  31.86 
 
 		 1193 aa  47  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  41.33 
 
 		 1125 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.41 
 
 		 432 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  24.43 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  30.12 
 
 		 1005 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  23.66 
 
 		 442 aa  46.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  28.57 
 
 		 457 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  35.9 
 
 		 441 aa  45.8  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  23.85 
 
 		 449 aa  45.8  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.53 
 
 		 441 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  25.41 
 
 		 430 aa  45.8  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  28.26 
 
 		 276 aa  45.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  29.93 
 
 		 422 aa  45.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.93 
 
 		 422 aa  45.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  26.63 
 
 		 275 aa  45.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.15 
 
 		 441 aa  45.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29.2 
 
 		 419 aa  45.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.25 
 
 		 444 aa  44.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1113 aa  44.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.01 
 
 		 429 aa  44.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>