14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1000 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  88.47 
 
 		 953 aa  1597    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 954 aa  1905    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  29.41 
 
 		 980 aa  78.2  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  28.91 
 
 		 944 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  30.73 
 
 		 997 aa  72.4  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  31.98 
 
 		 892 aa  69.7  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  27.76 
 
 		 885 aa  67.4  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  27.8 
 
 		 683 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 		 1160 aa  52.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  23.17 
 
 		 419 aa  49.3  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.37 
 
 		 997 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  25.69 
 
 		 1004 aa  47  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  25.21 
 
 		 730 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.03 
 
 		 567 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>