17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2952 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 683 aa  1387    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  30.47 
 
 		 646 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  22.6 
 
 		 1160 aa  81.3  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  44.19 
 
 		 997 aa  64.3  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  21.66 
 
 		 997 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  44.83 
 
 		 944 aa  53.9  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  27.8 
 
 		 954 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  28.23 
 
 		 766 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  25.11 
 
 		 953 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  32.26 
 
 		 885 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  29.17 
 
 		 885 aa  48.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2931  WD40 domain protein beta Propeller  34.83 
 
 		 1029 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.95 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  26.77 
 
 		 892 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.35 
 
 		 567 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  24.77 
 
 		 357 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  24.21 
 
 		 316 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>