13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3821 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  100 
 
 		 953 aa  1903    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  88.51 
 
 		 954 aa  1628    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  29.86 
 
 		 944 aa  75.5  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  31.16 
 
 		 980 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  30.24 
 
 		 997 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  29 
 
 		 885 aa  67.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  30.96 
 
 		 892 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  25.11 
 
 		 683 aa  51.6  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  28.38 
 
 		 1160 aa  51.6  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  26.4 
 
 		 730 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  28.66 
 
 		 646 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.41 
 
 		 567 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.76 
 
 		 419 aa  45.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>