17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1821 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  41.22 
 
 
980 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  44.23 
 
 
885 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  100 
 
 
892 aa  1812    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  33.59 
 
 
944 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  30.92 
 
 
997 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  27.08 
 
 
1004 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  31.98 
 
 
954 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  30.96 
 
 
953 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  24.39 
 
 
730 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  44.29 
 
 
766 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  26.97 
 
 
1160 aa  63.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  45.45 
 
 
646 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.05 
 
 
997 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 
316 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  37.84 
 
 
885 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  26.77 
 
 
683 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25.13 
 
 
440 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>