12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3711 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  100 
 
 		 730 aa  1490    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  28.11 
 
 		 944 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  23.23 
 
 		 885 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  28.65 
 
 		 646 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  26.05 
 
 		 892 aa  65.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  22.48 
 
 		 1160 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  25.26 
 
 		 997 aa  59.3  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  22.08 
 
 		 885 aa  57.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  24.89 
 
 		 980 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  26.4 
 
 		 953 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  25.21 
 
 		 954 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  38.18 
 
 		 766 aa  44.3  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>