22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10920 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  68.81 
 
 		 511 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  100 
 
 		 526 aa  1080    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  66.24 
 
 		 519 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  65.61 
 
 		 519 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  68.23 
 
 		 539 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  66.03 
 
 		 519 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  65.82 
 
 		 557 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  67.69 
 
 		 543 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  62.16 
 
 		 523 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  59.6 
 
 		 536 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  58.71 
 
 		 536 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.21 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  26 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  34.85 
 
 		 820 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  25 
 
 		 1610 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  31.91 
 
 		 641 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  23.36 
 
 		 867 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  24.34 
 
 		 1610 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 892 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1121 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.92 
 
 		 805 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.38 
 
 		 510 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>