81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0144 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  100 
 
 
812 aa  1664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  39.51 
 
 
1009 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  39.21 
 
 
1009 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  40.67 
 
 
1015 aa  197  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  37.85 
 
 
1010 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  37.95 
 
 
1114 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  37.05 
 
 
1138 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  30.73 
 
 
697 aa  184  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  35.12 
 
 
1065 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  29.68 
 
 
662 aa  181  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  37.99 
 
 
1039 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  33.43 
 
 
1034 aa  163  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  30.61 
 
 
744 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  29.52 
 
 
739 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  29.57 
 
 
736 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0025  hypothetical protein  35.58 
 
 
1194 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  34.32 
 
 
400 aa  141  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  34 
 
 
1227 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  30.19 
 
 
695 aa  132  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  28.05 
 
 
835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  27.49 
 
 
896 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  31.05 
 
 
815 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  31.05 
 
 
815 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  33.33 
 
 
818 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  31.45 
 
 
788 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  31.45 
 
 
788 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  29.25 
 
 
509 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  31.58 
 
 
789 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  29.54 
 
 
1170 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  29.52 
 
 
431 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  35.62 
 
 
806 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  31.33 
 
 
1665 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  28.66 
 
 
781 aa  108  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  27.59 
 
 
789 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  26.35 
 
 
413 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  26.39 
 
 
489 aa  100  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  26.55 
 
 
736 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  32.52 
 
 
1003 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  26.32 
 
 
778 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  36.88 
 
 
971 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  26.79 
 
 
761 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal 
 
 
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  41.03 
 
 
967 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2633  hypothetical protein  41.73 
 
 
999 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.753628  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4558  hypothetical protein  33.71 
 
 
1173 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  31.01 
 
 
962 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4602  hypothetical protein  33.14 
 
 
1160 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  27.31 
 
 
892 aa  73.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0933  hypothetical protein  33.53 
 
 
218 aa  69.3  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  26.29 
 
 
476 aa  67  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.87 
 
 
748 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1212  virulence-associated E family protein  27.93 
 
 
725 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  27.27 
 
 
749 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0934  hypothetical protein  26.9 
 
 
181 aa  57.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.9 
 
 
261 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40917  predicted protein  45.16 
 
 
180 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.251783  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  44.44 
 
 
1000 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  48.33 
 
 
590 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46933  predicted protein  41.38 
 
 
256 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  46.67 
 
 
444 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  43.84 
 
 
484 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  40.43 
 
 
223 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  45.61 
 
 
479 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  39.19 
 
 
239 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4909  TfoX domain-containing protein  40.43 
 
 
219 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3457  TfoX-like  40.43 
 
 
219 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0944213  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  46.67 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  31.67 
 
 
472 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  43.86 
 
 
648 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5170  hypothetical protein  25 
 
 
401 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196201  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  47.92 
 
 
598 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  50 
 
 
928 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  30.11 
 
 
411 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49933  predicted protein  46.43 
 
 
162 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  29.84 
 
 
407 aa  45.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  37.04 
 
 
630 aa  45.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.17 
 
 
768 aa  44.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  31.25 
 
 
582 aa  44.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  32.1 
 
 
499 aa  44.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.65 
 
 
926 aa  44.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  36.67 
 
 
841 aa  44.3  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>