18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1238 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  72.24 
 
 		 519 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  58.71 
 
 		 526 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  73.27 
 
 		 519 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  73.06 
 
 		 519 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  62.73 
 
 		 539 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  72.65 
 
 		 557 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  62.25 
 
 		 543 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  74.42 
 
 		 523 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  92.54 
 
 		 536 aa  1012    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  100 
 
 		 536 aa  1103    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  60.29 
 
 		 511 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.7 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  24.57 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 1121 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  32.84 
 
 		 820 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.45 
 
 		 831 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.6 
 
 		 892 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.35 
 
 		 510 aa  43.5  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>