25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1600 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  60.34 
 
 		 536 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  67.69 
 
 		 526 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  69.17 
 
 		 519 aa  733    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  68.92 
 
 		 519 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  100 
 
 		 539 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  68.3 
 
 		 519 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  65.9 
 
 		 511 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  98.11 
 
 		 543 aa  1068    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  65.09 
 
 		 523 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  63.73 
 
 		 536 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  68.51 
 
 		 557 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.71 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  28.47 
 
 		 493 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  23.45 
 
 		 867 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1121 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  23.6 
 
 		 1610 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  23.6 
 
 		 1610 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.23 
 
 		 510 aa  50.8  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  23.78 
 
 		 998 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  23.4 
 
 		 1403 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  23.98 
 
 		 553 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  23.94 
 
 		 1839 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  23.78 
 
 		 998 aa  47  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  25 
 
 		 856 aa  47  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  25.6 
 
 		 1056 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>