18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1058 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  73.21 
 
 		 519 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  58.71 
 
 		 526 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  73.92 
 
 		 519 aa  768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  74.03 
 
 		 519 aa  770    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  63.73 
 
 		 539 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  73.62 
 
 		 557 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  63.45 
 
 		 543 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  74.42 
 
 		 523 aa  823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 536 aa  1103    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  92.54 
 
 		 536 aa  1036    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  60.5 
 
 		 511 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.95 
 
 		 497 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  26.13 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 1121 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  32.09 
 
 		 820 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.34 
 
 		 892 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.45 
 
 		 831 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.12 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>