22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1283 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  70.96 
 
 		 536 aa  779    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  62.43 
 
 		 526 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  94.8 
 
 		 519 aa  999    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  98.27 
 
 		 519 aa  1060    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  67.81 
 
 		 539 aa  725    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  99.61 
 
 		 519 aa  1070    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  64.73 
 
 		 511 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  67.61 
 
 		 543 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  80.54 
 
 		 523 aa  880    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  71.89 
 
 		 536 aa  772    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 		 557 aa  1150    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.34 
 
 		 497 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  24.69 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.12 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  23 
 
 		 867 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  25.95 
 
 		 1839 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  21.71 
 
 		 1610 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  25.32 
 
 		 1403 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 1121 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  25.95 
 
 		 998 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  26.17 
 
 		 1610 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  26.28 
 
 		 998 aa  43.9  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>