59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2117 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 623 aa  1225    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  41.15 
 
 		 372 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  30.05 
 
 		 374 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  30.25 
 
 		 378 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  41.41 
 
 		 389 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  34.85 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  38.22 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  36 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  29.82 
 
 		 379 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  42.65 
 
 		 890 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  48.04 
 
 		 1150 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  30.75 
 
 		 363 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  37.33 
 
 		 368 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  35.37 
 
 		 427 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  43.75 
 
 		 2066 aa  144  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  31.61 
 
 		 823 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 352 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 352 aa  137  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  34.82 
 
 		 744 aa  133  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  40.2 
 
 		 1565 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  36.28 
 
 		 1916 aa  97.4  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  30.42 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  30.73 
 
 		 753 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  29.39 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  29.35 
 
 		 381 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  30.2 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  29.75 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  32.26 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  26.21 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  27.27 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  29.32 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  30.77 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  25.2 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  33.99 
 
 		 778 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  27.88 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  23.03 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  31.1 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.92 
 
 		 378 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25.6 
 
 		 865 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  24.86 
 
 		 402 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  26.28 
 
 		 379 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  26.28 
 
 		 379 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.67 
 
 		 375 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  30.09 
 
 		 364 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  26.35 
 
 		 379 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  26.28 
 
 		 379 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  25.96 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  23.24 
 
 		 363 aa  48.5  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  23.68 
 
 		 349 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  26.95 
 
 		 373 aa  47.8  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  23.12 
 
 		 827 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  25.32 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  23.4 
 
 		 379 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  23.18 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  23.21 
 
 		 644 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  26.63 
 
 		 612 aa  43.9  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>