42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04177 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04177  cellulase  100 
 
 		 590 aa  1194    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  42.98 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  42.68 
 
 		 584 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  66.36 
 
 		 256 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  56.28 
 
 		 231 aa  240  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  36.67 
 
 		 480 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 229 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 229 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  37.54 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  31.59 
 
 		 614 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  37.56 
 
 		 237 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  38.07 
 
 		 238 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  41.61 
 
 		 254 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.46 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  37.04 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  37.25 
 
 		 337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  34.32 
 
 		 251 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  25.15 
 
 		 608 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  29.04 
 
 		 542 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  38.03 
 
 		 366 aa  88.2  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 660 aa  87.4  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.55 
 
 		 2305 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  34.74 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  26.33 
 
 		 2310 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  24.32 
 
 		 597 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  23.7 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  23.01 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  22.88 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  21.39 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  19.66 
 
 		 1414 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  21.27 
 
 		 563 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  20.68 
 
 		 566 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  21.13 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  21.13 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  21.32 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  27.5 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  24.89 
 
 		 642 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  21.55 
 
 		 501 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>