17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2092 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  97.82 
 
 		 229 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  79.57 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  52.53 
 
 		 590 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  50.48 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  48.99 
 
 		 584 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 584 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  38.83 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  37.1 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  37.08 
 
 		 293 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.86 
 
 		 477 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  34.81 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  35.64 
 
 		 273 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  32.56 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  31.13 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  31.87 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  28.18 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>