19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0581 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  50.64 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  42.42 
 
 		 943 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  40.8 
 
 		 646 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  40.3 
 
 		 661 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1916 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.38 
 
 		 1565 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  28.8 
 
 		 2066 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  29.77 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.28 
 
 		 1991 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  28.84 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.73 
 
 		 1150 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  34.54 
 
 		 841 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.56 
 
 		 1183 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  29.68 
 
 		 1009 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  31.6 
 
 		 734 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  30.84 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  31.87 
 
 		 888 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.63 
 
 		 3563 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>