25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3237 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1152 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  100 
 
 		 1296 aa  2637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1125 aa  717    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  38.58 
 
 		 1110 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1278 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  33.31 
 
 		 1279 aa  619  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1347 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1123 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1134 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1017 aa  93.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1267 aa  79  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  22.59 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  20.09 
 
 		 1343 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  20.33 
 
 		 865 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1685 aa  72  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  22.46 
 
 		 882 aa  67  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1086 aa  65.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  20.04 
 
 		 882 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  29.63 
 
 		 668 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  33.77 
 
 		 741 aa  49.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  20.24 
 
 		 857 aa  49.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0715  hypothetical protein  32.32 
 
 		 135 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  30.77 
 
 		 468 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1113 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  34.21 
 
 		 578 aa  45.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>