19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1568 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  100 
 
 
1685 aa  3447    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  30.9 
 
 
1343 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  27.51 
 
 
1086 aa  308  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4254  hypothetical protein  27.63 
 
 
912 aa  275  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  24.36 
 
 
1106 aa  244  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  24.83 
 
 
1113 aa  236  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  25.33 
 
 
996 aa  196  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  37.6 
 
 
1278 aa  72.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  35.88 
 
 
1296 aa  72  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  26.53 
 
 
1279 aa  70.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  20.41 
 
 
1152 aa  59.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  24.62 
 
 
1347 aa  58.9  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  39.29 
 
 
741 aa  56.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  20.93 
 
 
1110 aa  54.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  19.6 
 
 
1017 aa  51.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  23.32 
 
 
1125 aa  49.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  21.2 
 
 
865 aa  50.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  32.91 
 
 
668 aa  49.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  27.42 
 
 
468 aa  45.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>