21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5949 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1296 aa  711    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  40.36 
 
 		 1110 aa  807    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  100 
 
 		 1152 aa  2352    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1125 aa  591  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1278 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1347 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1279 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1123 aa  409  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1134 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1017 aa  127  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  25.16 
 
 		 884 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  26.77 
 
 		 882 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  22.72 
 
 		 865 aa  86.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  24.91 
 
 		 882 aa  81.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1267 aa  81.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1086 aa  77.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1113 aa  62  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  20.41 
 
 		 1685 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1343 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  23.5 
 
 		 857 aa  51.6  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1106 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>