18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0566 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  100 
 
 
1086 aa  2221    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  32.97 
 
 
1113 aa  552  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  31.64 
 
 
1106 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  34.96 
 
 
1343 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  27.51 
 
 
1685 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  30.91 
 
 
996 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4254  hypothetical protein  31.08 
 
 
912 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  22.37 
 
 
1278 aa  81.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  22.68 
 
 
1152 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  20.17 
 
 
1296 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  21.64 
 
 
1125 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  22.1 
 
 
1017 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  26.47 
 
 
865 aa  61.6  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  20.61 
 
 
1134 aa  56.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  23.73 
 
 
1279 aa  50.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  23.13 
 
 
1110 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  21.67 
 
 
1347 aa  48.5  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  23.89 
 
 
884 aa  45.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>