32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4007 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  100 
 
 
1134 aa  2301    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  25.32 
 
 
1017 aa  191  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  28.63 
 
 
884 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  29.62 
 
 
865 aa  141  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  33.07 
 
 
882 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  25.36 
 
 
1267 aa  139  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  25.89 
 
 
1152 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  23.99 
 
 
1110 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  27.88 
 
 
1278 aa  131  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  29.86 
 
 
882 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  29.79 
 
 
1125 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  26.1 
 
 
1296 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  28.1 
 
 
1347 aa  116  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  30.75 
 
 
857 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  28.27 
 
 
1279 aa  106  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  23.63 
 
 
1123 aa  81.6  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5046  hypothetical protein  29.22 
 
 
325 aa  79  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  24.73 
 
 
1343 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  23.43 
 
 
1706 aa  66.6  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  23.47 
 
 
736 aa  62  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  25.06 
 
 
1106 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  20.79 
 
 
1086 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  40.2 
 
 
807 aa  59.3  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  38 
 
 
5203 aa  57  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  39.45 
 
 
5166 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  36.27 
 
 
2990 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  22.06 
 
 
996 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  37.5 
 
 
940 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  39.42 
 
 
941 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  33 
 
 
586 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  21.14 
 
 
1113 aa  48.5  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  24.48 
 
 
994 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>