14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3441 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 1106 aa  2273    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  50.46 
 
 		 1113 aa  1114    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1086 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  36.95 
 
 		 996 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1343 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1685 aa  244  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4254  hypothetical protein  32.84 
 
 		 912 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1125 aa  68.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  26.35 
 
 		 865 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1017 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1134 aa  58.9  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1278 aa  55.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  19.83 
 
 		 882 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1152 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>