24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1182 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1296 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 1125 aa  2322    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1152 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1278 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1110 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1347 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1279 aa  512  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1123 aa  432  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1134 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  25.88 
 
 		 884 aa  121  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1267 aa  109  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  28.7 
 
 		 865 aa  98.2  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  24.79 
 
 		 882 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  22.42 
 
 		 882 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1017 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3441  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1106 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.248128  normal  0.639428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1113 aa  62.4  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1086 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1343 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5046  hypothetical protein  26.93 
 
 		 325 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137607  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  29.81 
 
 		 902 aa  51.6  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  21.93 
 
 		 996 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1685 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4254  hypothetical protein  23.61 
 
 		 912 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>