26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1205 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  100 
 
 
884 aa  1757    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  71.8 
 
 
882 aa  1182    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  40.05 
 
 
882 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  34.53 
 
 
865 aa  442  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  35.08 
 
 
857 aa  351  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  33.78 
 
 
1017 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5046  hypothetical protein  44.74 
 
 
325 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  27.98 
 
 
1134 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  30.22 
 
 
1267 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  25.88 
 
 
1125 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  24.76 
 
 
1278 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  26.01 
 
 
1347 aa  99  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  25.47 
 
 
1152 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  26.98 
 
 
1279 aa  94.7  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  26.9 
 
 
1110 aa  88.2  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  22.59 
 
 
1296 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  23.06 
 
 
1123 aa  79.7  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  22.2 
 
 
736 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  25.95 
 
 
994 aa  66.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  23.02 
 
 
996 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  21.23 
 
 
1706 aa  62.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  23.38 
 
 
1011 aa  61.6  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5084  hypothetical protein  40.23 
 
 
93 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  20.75 
 
 
1343 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  20.88 
 
 
1113 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  23.89 
 
 
1086 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>