18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46569 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  100 
 
 
818 aa  1657    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46567  predicted protein  40.49 
 
 
528 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  26.79 
 
 
1000 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  35.4 
 
 
840 aa  62  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  40 
 
 
504 aa  62  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  38.17 
 
 
551 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.21 
 
 
555 aa  58.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  42.37 
 
 
136 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11401  predicted protein  39.81 
 
 
116 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121452  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  26.47 
 
 
630 aa  51.6  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  34.62 
 
 
1567 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  34.52 
 
 
633 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 
261 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  31.94 
 
 
735 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.68 
 
 
830 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.32 
 
 
3190 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.87 
 
 
2313 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  32.46 
 
 
1096 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>