19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0266 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4118  prepilin-type cleavage/methylation-like  36.24 
 
 
338 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.29573  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1864  hypothetical protein  26.94 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  35 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2370  hypothetical protein  38.46 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  28.77 
 
 
227 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1600  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  34.29 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  26.43 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  37.7 
 
 
236 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1058  hypothetical protein  23.91 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  27.42 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2567  hypothetical protein  28.3 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0973  hypothetical protein  36.07 
 
 
156 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  30.88 
 
 
211 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.69 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  33.68 
 
 
237 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  23.86 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  34.92 
 
 
208 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  27.42 
 
 
385 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>